1、裸子植物大多数是常绿植物,极稀为落叶性;茎内维管束环状排列,有形成层及次生生长,但木质部仅有管胞,而无导管,韧皮部有筛胞而无伴胞。叶为针形、条形、鳞片形,极少为扁平形的阔叶;2、具有形成层和次生生长,有年轮,少导管,韧皮部具筛胞,无伴胞;3、多为针形,条形或鳞片形,少为扁平阔叶。条形叶面的气孔纵向单列成气孔线。叶背的气孔线常多条紧密排列成浅色的气孔带。
裸子植物除少数类群外,均具有双黄酮类化合物,常见的有穗花杉双黄酮、西阿多黄素、银杏黄素、枯黄素、榧黄素等。黄酮类化合物则普遍存在,常见的有槲皮素、山奈酚和杨梅树皮素等。
裸子植物是一类没有真正的花和果实的植物，其种子通常直接暴露在环境中。裸子植物器官的特征主要包括：
1. 裸露的种子，没有外部果皮。
2. 没有真正的花，花被和雄蕊通常组成球状或锥状的“球花”或“锥花”。
3. 叶子通常为针状或鳞片状，少有大型复叶状叶子。
4. 没有真正的根，根系较浅，以地下茎、根冠和根毛为主要吸收营养的器官。裸子植物一般生长缓慢，多分布于温带和亚热带地区。
裸子植物只有四种，即：根、茎、叶、种子实际上裸子植物有类似花的结构，行驶花的职能高等的裸子植物，其繁殖器官与被子植物的花结构上也比较接近了但是不是花，这种结构叫做伪花
裸子植物有根、茎、叶、种子;蕨类植物有根、茎、叶;苔藓植物只有茎、叶,无根;而大部分的藻类植物根本没有器官的分化,一些单细胞藻类仅仅只是一个细胞而已,连组织都谈不上